Я работал в нескольких фирмах, ну и естественно организация структуры файлов везде была разная, а именно:
1) По типу макета (визитка, печать, штамп, буклет), и далее все скопом в одной папке... Макет именовался названием фирмы или ФИО заказчика.
*Не очень удобно листать список в несколько тысяч позиций.
2) По типу макета с разделением на полиграфию/наружк/промо. Далее по папкам с названием фирмы/фио закзачика. Все исходные данные лежат рядом с макетом по папкам.
*Тут появилась заморочка, если заказчик заказывает несколько видов продукции... приходится дублировать исходные данные по каждому виду, либо сваливать несколько разных типов макетов в одну папку, что естественно вызывает путаницу в последствии.
3) По типу продукции с разделением по времени заказа (год/месяц). Крупные заказы в отдельную папку со всеми исходными данными.
*Не очень удобно вспоминать что и когда было сделано.
4) На домашнем компе: по названию компании/фио заказчика, разделение по типам идет уже внутри.
Все эти структуры имеет свои плюсы и минусы. Я думаю что выбор структуры зависит от приоритетной деятельности компании, т.е. чего именно, каких именно заказов больше.
Но ИМХО однозначно важно называть вещи своими именами. Я придерживаюсь такой схемы: название фирмы/фио заказчика, тип продукции, формат (размер), версия... к готовому файлу добавляется [выбор заказчика], к файлу уходящему в печать — [на печать].
При поиске достаточно знать название фирмы/фио.